О НАС

альтернативный текст

Лаборатория прикладной энзимологии ФИЦ ПНЦБИ РАН была создана в начале 2019 года в рамках нацпроекта “НАУКА”. Основные требования к новым лабораториям были сформированы на рабочем совещании у заместителя Министра науки и высшего образования РФ А.М. Медведева 25.10.2018 г.:

Создание новых лабораторий должно быть направлено на комплексное развитие научных исследований и разработок в области передовых технологий, совершенствование системы технологического трансфера технологий и обеспечения быстрого перехода результатов исследований в стадию практического применения.

Таким образом, деятельность лаборатории направлена на исследование ферментов и оценку перспектив их использования на практике. Особое внимание уделяется развитию приборной и методической базы для полупромышленных экспериментов.

Лаборатория активно сотрудничает с коллегами из других организаций, ведёт переговоры с представителями промышленности и бизнеса с целью выстраивания конструктивного диалога по трансферу технологий из научной лаборатории к масштабируемому практическому применению.

НАШИ ИНТЕРЕСЫ

альтернативный текст
Безотходная переработка отходов

Во всём мире крабы являются излюбленным объектом рыбаков в связи с высокой ценой. Мировой известностью обладает камчатский краб. В последние десятилетия объём вылова этого краба российскими рыбаками достигает 15 000-20 000 тонн в год. Более половины улова камчатского краба - отходы. В среднем такие отходы могут составлять 50% от массы улова, которые зачастую сбрасывается сразу в море как отход производства. Cсылка на статью.

альтернативный текст
Идентификация гиалуронидазы краба

Гиалуронидазы представляют собой семейство ферментов, которые катализируют разложение гиалуроновой кислоты. Гиалуроновая кислота - высокомолекулярный отрицательно заряженный полимер, гликозаминогликан, состоящий из повторяющихся дисахаридных звеньев. Гиалуронидазы используются в медицине в сочетании с другими лекарственными средствами для ускорения фармакокинетики и фармакодинамики лекарственных препаратов. Гиалуронидазы млекопитающих используются в пластической хирургии и дерматологии. Манускрипт статьи в разработке.

альтернативный текст
Перспективы использования гиалуронидазы краба в медицине

В сотрудничестве с коллегами из других институтов наукограда Пущино нам удалось продемонстрировать структурные превращения гиалуроновой кислоты под действием ферментов гомогената гепатопанкреаса камчатского краба. Такие высокотехнологичные методы как атомно-силовая микроскопия (ИБ РАН) и ядерно-магнитный резонанс (ИТЭБ РАН) позволили наблюдать на молекулярном уровне разрушение гиалуроновой кислоты. Cсылка на статью.

НАШИ ПАРТНЕРЫ

Группа экспериментальных исследований и инженерии олигомерных структур Института белка РАН

Совместно с к.ф.-м.н. Тимченко А.А. и Ениным Г.А. была проведена работа по исследованию воздействия гомогената гепатопанкреаса камчатского краба на гиалуроновую кислоту методом атомно-силовой микроскопии.

Цели, решаемые методом атомно-силовой микроскопии (АСМ) чрезвычайно разнообразны:

  • идентификация микроорганизмов по их морфологии,
  • исследование влияния различных веществ на жизнедеятельность клеток,
  • визуализация и контроль образования фермент-субстратных комплексов,
  • контроль размеров, структуры и стабильности различных наноструктур, использующихся для доставки лекарственных средств,
  • визуализация единичных биомолекул и многое другое.

В группе имеется сканирующий зондовый микроскоп (СЗМ) NT-MDT Ntegra Vita (Зеленоград, Россия), позволяющий исследовать биологические объекты во всем диапазоне размеров исследуемых объектов - от целых бактерий и клеток различных живых организмов до отдельных белковых молекул.

Контакты
Тимченко Александр Александрович, atim@vega.protres.ru
Сайт: Институт белка РАН, Группа экспериментальных исследований и инженерии олигомерных структур

альтернативный текст
альтернативный текст

НОЦ Московского государственного областного университета (МГОУ)

Научно-образовательный центр МГОУ в г. Пущино является структурным подразделением Государственного образовательного учреждения высшего образования Московской области Московского государственного областного университета (МГОУ)

НОЦ был создан с целью
объединения научно-исследовательского потенциала, материально-технической, кадровой базы МГОУ и научно-исследовательских институтов РАН в г. Пущино и Московской области для проведения НИР и НИОКР, оказания научно-исследовательских, научно-производственных и иных услуг по направлениям биотехнологии и биомедицины в рамках реализации научных и образовательных программ Московской области.

Контакты
Директор НОЦ: Хохлова Татьяна Ивановна, ti.khokhlova@mgou.ru
Заместитель директора: Кашинцев Андрей Владимирович, av.kashincev@mgou.ru
Сайт: НОЦ МГОУ в г.Пущино

альтернативный текст

Лаборатория ЯМР исследований биосистем ИТЭБ РАН

Исследование белков, входящих в состав гомогената гепатопанкреаса камчатского краба, и их ферментативной активности проводятся в тесном сотрудничестве с Лабораторией ЯМР исследований биосистем ИТЭБ РАН с непосредственным участием сотрудников лаборатории Молчанова М.В. и зав. лаб. Кутышенко В.П.

В настоящее время ЯМР-спектроскопия является важным методом изучения в химии и биологии. Одно из направлений ЯМР-спектроскопии - это структурные исследования. ЯМР-спектроскопия позволяет определять пространственные структуры молекул, например, структуры белков. ЯМР-релаксация дает возможность изучать подвижность молекул, различать отдельные компоненты смесей по их подвижности.

Лаборатория оснащена ЯМР спектрометром Bruker 600 AVANCE III (Bruker BioSpin, Райнштеттен, Германия).

Основными направлениями исследования Лаборатории ЯМР исследований биосистем являются:

  • изучение структуры и динамики белков в различных состояниях и взаимодействия их с лигандами, а также молекулярных механизмов образования амилоидных наноструктур;
  • анализ биологических жидкостей и изучение метаболизма животных и человека для разработки методик ранней диагностики различных патологий с использованием ЯМР-спектроскопии.

Первые результаты совместной работы опубикованы в журнале PeerJ

Контакты
зав. лаб. Кутышенко Виктор Павлович - kutyshenko@rambler.ru
Сайт: Лаборатория ЯМР исследований биосистем

альтернативный текст

НАШИ ПЛАНЫ НА БЛИЖАЙШЕЕ БУДУЩЕЕ.
ПРИГЛАШАЕМ К СОТРУДНИЧЕСТВУ

Синтез рекомбинантной гиалуронидазы камчатского краба в экспрессионых системах

Гиалуронидаза - фермент, активно применяемый в медицине и косметологии. Сейчас лаборатория активно изучает ферментативные свойства гиалуронидазы из гепатопанкреаса камчатского краба. В ближайшей перспективе мы планируем приступить к экспрессии гена изучаемой гиалуронидазы в экспрессионных системах с целью оценки возможности получения препарата данной гиалуронидазы для нужд медицины и косметологии. Будем рады сотрудничеству с опытными коллегами.

Клинические исследования пищевой ценности ферментативного гидролизата изолята белка сои

Сотрудниками лаборатории разрабатывается технологический регламент получения гидролизата белка в полупромышленном масштабе. Конечный продукт будет тестироваться на безопасность и эффективность на животных моделях. В дальнейшем мы планируем провести клинические исследования на добровольцах. Приглашаем к сотрудничеству заинтересованных лиц, врачей, а также добровольцев.

Кормовые добавки на основе отходов переработки камчатского краба

Лаборатория разрабатывает технологию получения очищенного препарата гиалуронидазы из гепатопанкреаса камчатского краба. Один из вариантов исходного сырья - смесь отходов переработки краба (карапакс, внутренние органы, в т.ч. гепатопанкреас). После извлечения ферментов, кашу необходимо превратить в другой ценный продукт - например, корм или пищевую добавку для животных. Очень ждём специалистов в этой области для созидательной совместной деятельности.

СОТРУДНИЧЕСТВО

В сложившихся условиях ограниченных ресурсов (финансы, профессионалы, время) реализация научных проектов высокого уровня сложности требует объединения усилий нескольких лабораторий и групп.

Общие интересы, взаимовыгодное сотрудничество, постоянный обмен информацией, и доверие друг к другу - основа успеха. Наша лаборатория открыта к обсуждению и готова выстраивать деловые отношения по указанным принципам успешности.

Выше перечислены наши рабочие планы на ближайшее будущее. Мы рады предложить взаимовыгодное сотрудничество: соавторство в публикациях, выполнение договора на выполнение НИР или НИОКР, совместную реализацию смежных проектов.

Мы на связи!





Напишите нам прямо сейчас









ЦКП ФИЦ ПНЦБИ РАН
Оборудование и услуги Сектора прикладной энзимологии

Предлагаемые услуги

Типовые

  • Фильтрация на полых волокнах: растворимая/нерастворимая, клеточная/безклеточная фракция (до 5 л/запуск), в том числе при 4–8 ◦C
  • Концентрирование водного раствора на полых волокнах (до 10 л/запуск), в том числе при 4–8 ◦C
  • Диализ на полых волокнах (до 5 л/запуск), в том числе при 4–8 ◦C
  • Лиофилизация: глубокая заморозка (-40 ◦C), лиофильная сушка (до 5 л воды/запуск), расчет сухого вещества
  • Гомогенизация: ножевая, ротор-статор (до 4 л/запуск)
  • Тщательное смешивание жидких компонентов, получение эмульсии (до 4 л/запуск)
  • • Контролируемая температурная инкубация с активным перемешиванием (10–70 ◦C, до 4 л/запуск)
  • Измерение протеолетической активности (на основе ГОСТ 34430-2018)

Комплексные

  • Разработка технологических процедур ферментативного гидролиза белка и других биотехнологических процедур
Оборудование

Полупромышленное

  • Гомогенизатор-смеситель ИС-5 ("БиоПищеМаш")
  • Лиофильная сушилка ЛС-1000 ("Проинтех")
  • Ларь морозильный SE40-45 ("TEFCOLD")
  • Аппарат разделительный АР-0.2-300ПС, АР-0.2-100ПС, АР-0.2-50ПС и АР-0.2-5ПВХ ("Биотест") в комплекте с двумя насосами

Аналитическое

  • Спектрофотометр UNICO 1201
  • Центрифуга Eppendorf 5782 R и MiniSpin G
  • Термостат твёрдотельный TT-2 и суховоздушный ТВ-20-П3-К
  • Весы аналитические Ohaus PX224 и Navigator NVT
  • Пипетки автоматические Eppendorf
альтернативный текст
Потенциальные пользователи
  • Лаборатории ФИЦ ПНЦБИ РАН
  • Стороние НИИ
  • Пищевые и биотехнологические предприятия
  • Другие юридические и физические лица
Наши контакты

Руководитель Сектора: к.б.н., Евгений Согорин

evgenysogorin@gmail.com

+7 915 132 54 19

Место расположения: Институт биологического приборостроения

Камчатский краб

Камчатский краб - излюбленный деликатес не только в России, но и во всём мире. Его популярность распространяется не только среди любителей хорошо и с пользой поесть. В 90х годах прошлого века наблюдался бум фундаментальных и прикладных научных работ по переработке вторичных ресурсов крабьевого промысла. Самым популярным объектом в этой истории был пищеварительный орган - гепатопанкреас краба. С тех времён охарактеризовано более десятка пищеварительных ферментов - некоторые ферменты гепатопанкреаса стали частью наборов для молекулярной биологии, некоторые расширили наше фундаментальное понимание о пространственной организации биологических катализаторов. Гепатопанкреас краба это котёл, бурлящий множеством ферментов разнообразной активности, и этому есть объяснение - жизнь краба непроста.

Крабы ведут донный образ жизни, перемещаясь в диапазоне глубин от 5–10 до 250–300 м. Они осваивают кормовые ресурсы шельфа и верхней части свала глубин питаются червями, моллюсками, не брезгуют трупами погибших животных - выбирать не приходится. В пищеварительный тракт (в среднюю кишку) впадают протоки гепатопанкераса: ферменты расщепляют пищу, и ее фрагменты попадают в железу, где происходит также ее всасывание. Поэтому и говорят, что гепатопанкреас по функции это одновременно и поджелудочная железа и печень. Нижняя часть водного слоя дальневосточных морей прогревается медленно и остается охлажденной до отрицательной температуры в течение всего года. При сильном льдообразовании зимой вода осолоняется, отпускается на дно и плохо перемешивается. Такие недружелюбные условия, небогатый выбор рациона питания привели к тому, что пищеварительные ферменты приспособились работать при низких температурах с "нативной" пищей, то есть пищей, которая не подвергается предварительной обработки соляной кислотой, просто потому что её у краба нет. Именно с этим связано наличие столь широкого диапазона всевозможных ферментов в гепатопанкреасе - надо уметь переваривать всё. Без предварительной кислотной денатурации большую проблему мог бы вызвать нативный коллаген сырого мяса, однако и тут краб справился - известны две его коллагеназы, способные расщеплять жесткую тройную спираль этого белка в нативной её форме. Жизнь краба это способность переваривать дары моря даже если они не в твоем вкусе.

Исследования его ферментов снова набирают потенциал. Понимание о бережливом природопользовании (переработка вторичных отходов) добралось и до России. В Норвегии объёмы вылова акклиматизированного камчатского краба увеличиваются год от года, и в этой стране будут вынуждены также прийти к выводу, что ценное сырьё не стоит выбрасывать в море. В нашей лаборатории недавно было показано, что гомогенат гепатопанкреаса краба можно использовать в борьбе с побочными эффектами при использовании филлеров на основе гиалуроновой кислоты. Оказалось, что уровень активности полученного препарата сравним с коммерчески используемыми препаратами гиалуронидаз, которые используются и в других целях в медицине и косметологии. Сегодняшние наши усилия направлены на выяснение особенностей структуры и функционирования гиалуронидазы камчатского краба, разрабатываются регламенты полупромышленного её получения из отходов переработки краба. Также в планах изучение потенциала использования гиалуронидазы при лечении фиброза лёгких у модельных животных.

НАША КОМАНДА

Татьяна

"Мы пришли в этот мир, чтобы становиться лучше каждый день. Учиться, развиваться, терпеть неудачу и снова подниматься. Большое счастье для меня работать в команде единомышленников. Благодарю, вас, мои друзья!"

Дмитрий

"Для меня то чем я занимаюсь, это не только очень важные и интересные научные исследования, хитрые задачи, требующие решения и поиск нового. Это ещё и созидание, инвестиция в будущее. Моё будущее и будущее многих других людей, я надеюсь. А ещё наука - это очень круто! Люди в белых халатах, исследующие непознанное, такие же рок-звёзды, как Джимми Хендрикс и Оззи Осборн."

Евгений

"Я отношусь к становлению новой лаборатории как к стартапу - никогда его не делал, но, впечатления, наверное, такие же: уровень неопределенности высокий, велико количество разноплановых задач, процесс организации лаборатории требует новых навыков и умений - каждый день приходится учиться чему-то новому и очень быстро. Сейчас интересное для меня время и я рад, что вокруг меня складывается замечательная команда. Да прибудет с нами fun!"

Сергей

"Главное для меня постоянная личная трансформация и помощь в такой трансформации другим. Оказывая такую поддержку, для меня важно видеть, как человек становится более осведомленным о себе и более осознанным в действиях. Я верю, что это поможет построить новые современные или даже постсовременные отношения внутри вида Homo Sapiens."

Маша

"Современный мир каждый день бросает нам вызов, и мы должны достойно отвечать на эти вызовы. Наука дает нам шанс противостоять им и находить решения сложных биологических, медицинских и экологических задач. Химическое образование позволяет мне работать на стыке наук: химии, физики, биологии, медицины, и разрабатывать новые подходы к лечению и диагностике наиболее социально значимых заболеваний. В этом мне помогает и мой любимый вид спорта – ultimate frisbee: вижу цель и должна ее достигнуть".

Саша

Никита

Миша